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CEFITEC - Centro de Física e Investigação Tecnológica
CENIMAT/I3N - Centro de Investigação de Materiais (integra o Laboratório Associado I3N - Instituto de Nanoestruturas, Nanomodelação e Nanofabricação)
CENSE - Centro de Investigação em Ambiente e Sustentabilidade
CENTRIA - Centro de Inteligência Artificial
CICEGe - Centro de Investigação em Ciência e Engenharia Geológica
CITI - Centro de Informática e Tecnologias da Informação
CIUHCT - Centro Interuniversitário de História das Ciências e da Tecnologia
CMA - Centro de Matemática e Aplicações
CQFB/REQUIMTE - Centro de Química Fina e Biotecnologia (integra o Laboratório Associado de Química Verde - Tecnologias e Processos Limpos REQUIMTE)
CREM - Centro de Recursos Microbiológicos
IET - Centro de Investigação em Inovação Empresarial e do Trabalho
UBiA - Unidade de Biotecnologia Ambiental
UIED - Unidade de Investigação em Educação e Desenvolvimento
UNIC - Centro de Investigação em Estruturas e Construção
UNIDEMI - Unidade de Investigação e Desenvolvimento em Engenharia Mecânica e Industrial
VICARTE - Centro do Vidro e Cerâmica para as Artes
CFA-FCT - Centro de Física Atómica - FCT - Pólo do Centro de Física Atómica
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